Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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