Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFEMP1Q12805 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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