Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms