Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms