Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms