Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCBP4P57723 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms