Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms