Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms