Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms