Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms