Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms