Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BMP4P12644 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms