Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms