Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSH5O43196 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSH5O43196 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSH5O43196 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AL513285.1-201ENST00000423187 432 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC080080.2-201ENST00000624307 590 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSH5O43196 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSH5O43196 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 PGM5P4-AS1-204ENST00000450636 537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 PDE4D-209ENST00000502575 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AL133330.1-201ENST00000510619 704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 LYSMD2-203ENST00000558126 775 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSH5O43196 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MSH5O43196 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MSH5O43196 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSH5O43196 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSH5O43196 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSH5O43196 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSH5O43196 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSH5O43196 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms