Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms