Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A4Q9UP95 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 722.6 ms