Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GALPQ9UBC7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALPQ9UBC7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GALPQ9UBC7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GALPQ9UBC7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms