Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC44A1Q8WWI5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms