Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C3Q8NEB9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C3Q8NEB9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3C3Q8NEB9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms