Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PNLDC1Q8NA58 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PNLDC1Q8NA58 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms