Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR3Q6ZTQ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR3Q6ZTQ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDHR3Q6ZTQ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms