Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6Q795 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6Q795 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6Q795 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6Q795 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6Q795 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6Q795 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6Q795 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6Q795 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6Q795 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6Q795 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6Q795 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6Q795 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6Q795 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6Q795 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6Q795 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6Q795 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6Q795 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6Q795 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6Q795 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6Q795 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6Q795 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6Q795 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6Q795 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6Q795 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6Q795 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6Q795 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6Q795 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6Q795 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6Q795 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6Q795 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6Q795 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6Q795 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6Q795 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6Q795 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6Q795 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6Q795 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6Q795 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q6Q795 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6Q795 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6Q795 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6Q795 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6Q795 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6Q795 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6Q795 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6Q795 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6Q795 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6Q795 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6Q795 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6Q795 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6Q795 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6Q795 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6Q795 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6Q795 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6Q795 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6Q795 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6Q795 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6Q795 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6Q795 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6Q795 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6Q795 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6Q795 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6Q795 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6Q795 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms