Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 YCK1YHR135C 1617 nt6.41□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.41□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 EGD2YHR193C 525 nt6.41□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 SHP1YBL058W 1272 nt6.41□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 ADE12YNL220W 1302 nt6.41□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 GAA1YLR088W 1845 nt6.41□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 NTE1YML059C 5040 nt6.4□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 YDL129WYDL129W 876 nt6.4□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 YDR401WYDR401W 564 nt6.4□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 PRS2YER099C 957 nt6.4□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.4□□□□□ -1.38
CTF3Q12748 AIM3YBR108W 2844 nt6.4□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 HSP12YFL014W 330 nt6.39□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 SYF2YGR129W 648 nt6.39□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 CIN4YMR138W 576 nt6.39□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 YTP1YNL237W 1380 nt6.39□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 PRP2YNR011C 2631 nt6.39□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 OPT1YJL212C 2400 nt6.38□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 UGX2YDL169C 672 nt6.38□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 DFM1YDR411C 1026 nt6.38□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 TSA1YML028W 591 nt6.38□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 WHI2YOR043W 1461 nt6.38□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 PYC2YBR218C 3543 nt6.38□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 PGM1YKL127W 1713 nt6.37□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 MKK1YOR231W 1527 nt6.37□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 YEL068CYEL068C 333 nt6.37□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 ORM1YGR038W 669 nt6.37□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 SPO7YAL009W 780 nt6.37□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 RRN10YBL025W 438 nt6.37□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt6.37□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 YDL172CYDL172C 480 nt6.36□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 COX20YDR231C 618 nt6.36□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 ASK1YKL052C 879 nt6.36□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 RPL21AYBR191W 483 nt6.36□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 PYK2YOR347C 1521 nt6.35□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.35□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 ERP5YHR110W 639 nt6.35□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 YIR042CYIR042C 711 nt6.35□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 ATG17YLR423C 1254 nt6.35□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 OST3YOR085W 1053 nt6.35□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 SMK1YPR054W 1167 nt6.35□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 BDF2YDL070W 1917 nt6.35□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 ISN1YOR155C 1353 nt6.34□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 HAP3YBL021C 435 nt6.34□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 CSL4YNL232W 879 nt6.34□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 BSC4YNL269W 396 nt6.34□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 YPR114WYPR114W 948 nt6.34□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 ECM38YLR299W 1983 nt6.34□□□□□ -1.39
CTF3Q12748 PRI2YKL045W 1587 nt6.33□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 LEU5YHR002W 1074 nt6.33□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 DMA1YHR115C 1251 nt6.33□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.33□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 MRPS5YBR251W 924 nt6.33□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 DAL4YIR028W 1908 nt6.33□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 CRP1YHR146W 1398 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 PXL1YKR090W 2121 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 COR1YBL045C 1374 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 TPO3YPR156C 1869 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 ACO1YLR304C 2337 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 MTF2YDL044C 1323 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 YML133CYML133C 4125 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 RAD24YER173W 1980 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 YGL235WYGL235W 537 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 COA1YIL157C 594 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 CDC11YJR076C 1248 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.32□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 ARP3YJR065C 1350 nt6.31□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 VTS1YOR359W 1572 nt6.31□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 GYP8YFL027C 1494 nt6.31□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 BCY1YIL033C 1251 nt6.31□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 YNL200CYNL200C 741 nt6.31□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 PAP2YOL115W 1755 nt6.31□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 IME2YJL106W 1938 nt6.31□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 HST3YOR025W 1344 nt6.3□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 GUD1YDL238C 1470 nt6.3□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 GTT3YEL017W 1014 nt6.3□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 HMS2YJR147W 1077 nt6.3□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 REC114YMR133W 1287 nt6.3□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 ATG12YBR217W 561 nt6.3□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 SKY1YMR216C 2229 nt6.3□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 ARG81YML099C 2643 nt6.29□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 RSP5YER125W 2430 nt6.29□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 JIP4YDR475C 2631 nt6.29□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 VPS61YDR136C 573 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 PHB1YGR132C 864 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 YHM2YMR241W 945 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 YBL070CYBL070C 321 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 AFG1YEL052W 1530 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 ATG4YNL223W 1485 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 ENP1YBR247C 1452 nt6.28□□□□□ -1.4
CTF3Q12748 GUF1YLR289W 1938 nt6.27□□□□□ -1.41
CTF3Q12748 AIM33YML087C 939 nt6.27□□□□□ -1.41
CTF3Q12748 MSN2YMR037C 2115 nt6.26□□□□□ -1.41
CTF3Q12748 MRK1YDL079C 1506 nt6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms