Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 BNA3YJL060W 1335 nt9.49□□□□□ -0.89
YPK9Q12697 ITR1YDR497C 1755 nt9.49□□□□□ -0.89
YPK9Q12697 MRPL36YBR122C 534 nt9.48□□□□□ -0.89
YPK9Q12697 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt9.47□□□□□ -0.89
YPK9Q12697 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt9.47□□□□□ -0.89
YPK9Q12697 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt9.47□□□□□ -0.89
YPK9Q12697 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt9.47□□□□□ -0.89
YPK9Q12697 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt9.47□□□□□ -0.89
YPK9Q12697 YMR155WYMR155W 1644 nt9.47□□□□□ -0.89
YPK9Q12697 PAN6YIL145C 930 nt9.47□□□□□ -0.89
YPK9Q12697 ARR3YPR201W 1215 nt9.47□□□□□ -0.89
YPK9Q12697 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt9.46□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 NTG1YAL015C 1200 nt9.46□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 MLC1YGL106W 450 nt9.45□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 YNL190WYNL190W 615 nt9.45□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 PMT3YOR321W 2262 nt9.45□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 SOG2YOR353C 2376 nt9.44□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 GID7YCL039W 2238 nt9.44□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 GAA1YLR088W 1845 nt9.44□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 YHM2YMR241W 945 nt9.43□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 BSC4YNL269W 396 nt9.43□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt9.43□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 AMD1YML035C 2433 nt9.43□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 DJP1YIR004W 1299 nt9.42□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 APE3YBR286W 1614 nt9.42□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 HSM3YBR272C 1443 nt9.42□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 GPH1YPR160W 2709 nt9.41□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 GTB1YDR221W 2109 nt9.4□□□□□ -0.9
YPK9Q12697 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt9.4□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 YNL019CYNL019C 855 nt9.4□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 YNL033WYNL033W 855 nt9.4□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 PSY4YBL046W 1326 nt9.39□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 LAS17YOR181W 1902 nt9.39□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 POB3YML069W 1659 nt9.39□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 ORC5YNL261W 1440 nt9.39□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 RPS9AYPL081W 594 nt9.39□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 YBR144CYBR144C 315 nt9.39□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 RTG2YGL252C 1767 nt9.38□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 SUF5tG(CCC)O 72 nt9.38□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 PRO3YER023W 861 nt9.38□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 DPH5YLR172C 903 nt9.37□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 YCL041CYCL041C 495 nt9.36□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 PGM1YKL127W 1713 nt9.36□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 SHM1YBR263W 1473 nt9.35□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 OPI8YKR035C 642 nt9.35□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 VPS61YDR136C 573 nt9.34□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 BCY1YIL033C 1251 nt9.34□□□□□ -0.91
YPK9Q12697 GIT1YCR098C 1557 nt9.33□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 ECM27YJR106W 2178 nt9.33□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt9.33□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 SEC20YDR498C 1152 nt9.32□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 HHY1YEL059W 309 nt9.32□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 YDR109CYDR109C 2148 nt9.31□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 APS3YJL024C 585 nt9.31□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 KKQ8YKL168C 2175 nt9.31□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt9.3□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 SFC1YJR095W 969 nt9.3□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 YBR124WYBR124W 360 nt9.3□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 YLR173WYLR173W 1827 nt9.29□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt9.29□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 HSX1tR(CCU)J 72 nt9.29□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 SES1YDR023W 1389 nt9.29□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 GIR2YDR152W 798 nt9.28□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 PGU1YJR153W 1086 nt9.28□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 CSG2YBR036C 1233 nt9.28□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 MTC1YJL123C 1437 nt9.27□□□□□ -0.92
YPK9Q12697 YDR154CYDR154C 351 nt9.27□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 YGR182CYGR182C 354 nt9.27□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 YAP1801YHR161C 1914 nt9.26□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 PRM10YJL108C 1152 nt9.26□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 YKL151CYKL151C 1014 nt9.26□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 ATP14YLR295C 375 nt9.26□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 COX5AYNL052W 462 nt9.26□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 TEP1YNL128W 1305 nt9.26□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 YCL065WYCL065W 369 nt9.25□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 YDL034WYDL034W 345 nt9.25□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 COA1YIL157C 594 nt9.25□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 ICT1YLR099C 1185 nt9.25□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 VRP1YLR337C 2454 nt9.25□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 QNS1YHR074W 2145 nt9.25□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt9.24□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 BDF2YDL070W 1917 nt9.23□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 TIM54YJL054W 1437 nt9.23□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 XBP1YIL101C 1944 nt9.23□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 RPT3YDR394W 1287 nt9.22□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 CAD1YDR423C 1230 nt9.22□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 RPT6YGL048C 1218 nt9.22□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 YNR042WYNR042W 429 nt9.22□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 GLN1YPR035W 1113 nt9.22□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 GYP8YFL027C 1494 nt9.22□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 GLE1YDL207W 1617 nt9.22□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 YGR176WYGR176W 348 nt9.21□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 YPL062WYPL062W 405 nt9.21□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 EFM1YHL039W 1758 nt9.21□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 GAL2YLR081W 1725 nt9.21□□□□□ -0.93
YPK9Q12697 SLO1YER180C-A 258 nt9.21□□□□□ -0.94
YPK9Q12697 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt9.2□□□□□ -0.94
YPK9Q12697 DAL82YNL314W 768 nt9.2□□□□□ -0.94
YPK9Q12697 YRA1YDR381W 681 nt9.19□□□□□ -0.94
YPK9Q12697 SUP19tS(UGA)E 82 nt9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 104.3 ms