Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63121 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63121 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms