Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMPRSS3P57727 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS3P57727 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms