Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF4P48230 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF4P48230 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms