Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 CDC34YDR054C 888 nt7.06□□□□□ -1.28
VID28P40547 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt7.06□□□□□ -1.28
VID28P40547 RNH201YNL072W 924 nt7.06□□□□□ -1.28
VID28P40547 MDM31YHR194W 1740 nt7.06□□□□□ -1.28
VID28P40547 GUD1YDL238C 1470 nt7.05□□□□□ -1.28
VID28P40547 TPK1YJL164C 1194 nt7.05□□□□□ -1.28
VID28P40547 YPL071CYPL071C 471 nt7.05□□□□□ -1.28
VID28P40547 JNM1YMR294W 1122 nt7.04□□□□□ -1.28
VID28P40547 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.04□□□□□ -1.28
VID28P40547 RRS1YOR294W 612 nt7.04□□□□□ -1.28
VID28P40547 YML133CYML133C 4125 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 ICL1YER065C 1674 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 BUD9YGR041W 1644 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 YDR015CYDR015C 240 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 DOT5YIL010W 648 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 YUR1YJL139C 1287 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 ATG23YLR431C 1362 nt7.03□□□□□ -1.28
VID28P40547 MRPL1YDR116C 858 nt7.02□□□□□ -1.29
VID28P40547 YGL235WYGL235W 537 nt7.02□□□□□ -1.29
VID28P40547 YMR147WYMR147W 672 nt7.02□□□□□ -1.29
VID28P40547 YNL017CYNL017C 339 nt7.02□□□□□ -1.29
VID28P40547 AVT4YNL101W 2142 nt7.02□□□□□ -1.29
VID28P40547 YDL218WYDL218W 954 nt7.01□□□□□ -1.29
VID28P40547 YML083CYML083C 1257 nt7.01□□□□□ -1.29
VID28P40547 ISC1YER019W 1434 nt7.01□□□□□ -1.29
VID28P40547 SIR2YDL042C 1689 nt7□□□□□ -1.29
VID28P40547 SKI2YLR398C 3864 nt7□□□□□ -1.29
VID28P40547 YEL068CYEL068C 333 nt7□□□□□ -1.29
VID28P40547 NMD5YJR132W 3147 nt7□□□□□ -1.29
VID28P40547 APM1YPL259C 1428 nt7□□□□□ -1.29
VID28P40547 YOL036WYOL036W 2286 nt6.99□□□□□ -1.29
VID28P40547 YDR401WYDR401W 564 nt6.99□□□□□ -1.29
VID28P40547 SRN2YLR119W 642 nt6.99□□□□□ -1.29
VID28P40547 TSA1YML028W 591 nt6.99□□□□□ -1.29
VID28P40547 CAF40YNL288W 1122 nt6.99□□□□□ -1.29
VID28P40547 PET112YBL080C 1626 nt6.98□□□□□ -1.29
VID28P40547 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.98□□□□□ -1.29
VID28P40547 GPI11YDR302W 660 nt6.98□□□□□ -1.29
VID28P40547 COS6YGR295C 1146 nt6.98□□□□□ -1.29
VID28P40547 LDS1YAL018C 978 nt6.98□□□□□ -1.29
VID28P40547 YPR114WYPR114W 948 nt6.98□□□□□ -1.29
VID28P40547 HAL5YJL165C 2568 nt6.98□□□□□ -1.29
VID28P40547 KNS1YLL019C 2214 nt6.97□□□□□ -1.29
VID28P40547 YHL017WYHL017W 1599 nt6.97□□□□□ -1.29
VID28P40547 RPS5YJR123W 678 nt6.97□□□□□ -1.29
VID28P40547 KKQ8YKL168C 2175 nt6.97□□□□□ -1.29
VID28P40547 YNL200CYNL200C 741 nt6.97□□□□□ -1.29
VID28P40547 MRPS16YPL013C 366 nt6.97□□□□□ -1.29
VID28P40547 TEP1YNL128W 1305 nt6.97□□□□□ -1.29
VID28P40547 MED6YHR058C 888 nt6.96□□□□□ -1.3
VID28P40547 TIF2YJL138C 1188 nt6.96□□□□□ -1.3
VID28P40547 TIF1YKR059W 1188 nt6.96□□□□□ -1.3
VID28P40547 ZRT2YLR130C 1269 nt6.96□□□□□ -1.3
VID28P40547 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.96□□□□□ -1.3
VID28P40547 GFA1YKL104C 2154 nt6.96□□□□□ -1.3
VID28P40547 PRP24YMR268C 1335 nt6.96□□□□□ -1.3
VID28P40547 HST3YOR025W 1344 nt6.96□□□□□ -1.3
VID28P40547 RRP46YGR095C 672 nt6.95□□□□□ -1.3
VID28P40547 EFM3YJR129C 1020 nt6.95□□□□□ -1.3
VID28P40547 OCA1YNL099C 717 nt6.95□□□□□ -1.3
VID28P40547 LYS21YDL131W 1323 nt6.95□□□□□ -1.3
VID28P40547 GDA1YEL042W 1557 nt6.95□□□□□ -1.3
VID28P40547 TPO3YPR156C 1869 nt6.94□□□□□ -1.3
VID28P40547 YHR140WYHR140W 720 nt6.94□□□□□ -1.3
VID28P40547 REV7YIL139C 738 nt6.94□□□□□ -1.3
VID28P40547 MOG1YJR074W 657 nt6.94□□□□□ -1.3
VID28P40547 HXT2YMR011W 1626 nt6.94□□□□□ -1.3
VID28P40547 FET4YMR319C 1659 nt6.93□□□□□ -1.3
VID28P40547 PGK1YCR012W 1251 nt6.93□□□□□ -1.3
VID28P40547 RPT3YDR394W 1287 nt6.93□□□□□ -1.3
VID28P40547 PHB1YGR132C 864 nt6.93□□□□□ -1.3
VID28P40547 BCY1YIL033C 1251 nt6.93□□□□□ -1.3
VID28P40547 PRE3YJL001W 648 nt6.93□□□□□ -1.3
VID28P40547 CIS3YJL158C 684 nt6.93□□□□□ -1.3
VID28P40547 IMA5YJL216C 1746 nt6.93□□□□□ -1.3
VID28P40547 YBR284WYBR284W 2394 nt6.93□□□□□ -1.3
VID28P40547 CNE1YAL058W 1509 nt6.92□□□□□ -1.3
VID28P40547 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.92□□□□□ -1.3
VID28P40547 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.92□□□□□ -1.3
VID28P40547 RPS28AYOR167C 204 nt6.92□□□□□ -1.3
VID28P40547 NHA1YLR138W 2958 nt6.92□□□□□ -1.3
VID28P40547 ENP1YBR247C 1452 nt6.92□□□□□ -1.3
VID28P40547 FRS2YFL022C 1512 nt6.91□□□□□ -1.3
VID28P40547 BUD32YGR262C 786 nt6.91□□□□□ -1.3
VID28P40547 ICT1YLR099C 1185 nt6.91□□□□□ -1.3
VID28P40547 RAD24YER173W 1980 nt6.91□□□□□ -1.3
VID28P40547 GYP8YFL027C 1494 nt6.91□□□□□ -1.3
VID28P40547 ATG4YNL223W 1485 nt6.91□□□□□ -1.3
VID28P40547 UTP4YDR324C 2331 nt6.9□□□□□ -1.3
VID28P40547 BIM1YER016W 1035 nt6.9□□□□□ -1.3
VID28P40547 BUR6YER159C 429 nt6.9□□□□□ -1.3
VID28P40547 GCV3YAL044C 513 nt6.9□□□□□ -1.3
VID28P40547 PDR18YNR070W 4002 nt6.9□□□□□ -1.3
VID28P40547 CEF1YMR213W 1773 nt6.9□□□□□ -1.31
VID28P40547 DPB2YPR175W 2070 nt6.89□□□□□ -1.31
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