Protein–RNA interactions for Protein: P38202

YBL028C, UPF0642 protein YBL028C, yeastyeast

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL028CP38202 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.9□□□□□ -1.3
YBL028CP38202 TKL2YBR117C 2046 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 RHB1YCR027C 630 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 YEL068CYEL068C 333 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 IES2YNL215W 963 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 PYK2YOR347C 1521 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 TPO3YPR156C 1869 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 YCK1YHR135C 1617 nt6.88□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 MRK1YDL079C 1506 nt6.88□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 MKK1YOR231W 1527 nt6.88□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 TMT1YER175C 900 nt6.88□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 PUF3YLL013C 2640 nt6.87□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 WHI2YOR043W 1461 nt6.87□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 CBP4YGR174C 513 nt6.87□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 TSA1YML028W 591 nt6.87□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 UTR2YEL040W 1404 nt6.86□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 PYC2YBR218C 3543 nt6.86□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 TRR1YDR353W 960 nt6.86□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 AAD15YOL165C 432 nt6.86□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 BRL1YHR036W 1416 nt6.85□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 NMT1YLR195C 1368 nt6.85□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 YBL070CYBL070C 321 nt6.85□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 HRQ1YDR291W 3234 nt6.85□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 EHD3YDR036C 1503 nt6.85□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 HDA1YNL021W 2121 nt6.85□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 GON7YJL184W 372 nt6.84□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 YPR114WYPR114W 948 nt6.84□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 EFM1YHL039W 1758 nt6.84□□□□□ -1.31
YBL028CP38202 SEC23YPR181C 2307 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 RAD24YER173W 1980 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 ERP2YAL007C 648 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 HMS2YJR147W 1077 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 MRPL22YNL177C 930 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 DAP1YPL170W 459 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 YML133CYML133C 4125 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 OPI8YKR035C 642 nt6.82□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 KIN1YDR122W 3195 nt6.82□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 YTP1YNL237W 1380 nt6.82□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 AFG1YEL052W 1530 nt6.81□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 GTT3YEL017W 1014 nt6.81□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 COX5AYNL052W 462 nt6.81□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 HXT15YDL245C 1704 nt6.81□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 HXT16YJR158W 1704 nt6.81□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 FZF1YGL254W 900 nt6.8□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.8□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 HAP3YBL021C 435 nt6.8□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 UBC11YOR339C 471 nt6.8□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 MDH3YDL078C 1032 nt6.79□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 CCP1YKR066C 1086 nt6.79□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 SLX5YDL013W 1860 nt6.79□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 MRP17YKL003C 396 nt6.78□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 AIM33YML087C 939 nt6.78□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 NSE5YML023C 1671 nt6.77□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 SRF1YDL133W 1314 nt6.77□□□□□ -1.32
YBL028CP38202 YFR006WYFR006W 1608 nt6.77□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt6.77□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 RPL21AYBR191W 483 nt6.77□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 ATF1YOR377W 1578 nt6.77□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 YPR204WYPR204W 3099 nt6.77□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 YGR022CYGR022C 330 nt6.76□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.76□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 ATP4YPL078C 735 nt6.76□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.75□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.75□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.75□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.75□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.75□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 BCY1YIL033C 1251 nt6.75□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 EFM4YIL064W 774 nt6.75□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 TPK1YJL164C 1194 nt6.75□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 YHM2YMR241W 945 nt6.75□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 ECM30YLR436C 3825 nt6.74□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 GUD1YDL238C 1470 nt6.74□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 ATG4YNL223W 1485 nt6.74□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 SES1YDR023W 1389 nt6.74□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 ADY2YCR010C 852 nt6.74□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 YBR144CYBR144C 315 nt6.74□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.73□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 PHB1YGR132C 864 nt6.73□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 DMA1YHR115C 1251 nt6.73□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 DAL3YIR032C 588 nt6.73□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 PGM1YKL127W 1713 nt6.73□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 IME2YJL106W 1938 nt6.72□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 YIR042CYIR042C 711 nt6.72□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 JIP4YDR475C 2631 nt6.72□□□□□ -1.33
YBL028CP38202 GLN1YPR035W 1113 nt6.71□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 PDR18YNR070W 4002 nt6.71□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 GPB2YAL056W 2643 nt6.71□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt6.7□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 YGL235WYGL235W 537 nt6.7□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 SYN8YAL014C 768 nt6.7□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 DCN1YLR128W 810 nt6.7□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 BSC4YNL269W 396 nt6.7□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 ARR3YPR201W 1215 nt6.7□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 HXT17YNR072W 1695 nt6.69□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 PAN6YIL145C 930 nt6.69□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 COA1YIL157C 594 nt6.69□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 GAT4YIR013C 366 nt6.69□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 ARG1YOL058W 1263 nt6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 226.8 ms