Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	SKS1	YPL026C	1509 nt		5.06	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	ICL1	YER065C	1674 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	YDL144C	YDL144C	1071 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	SHO1	YER118C	1104 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	DYS1	YHR068W	1164 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	SNN1	YNL086W	309 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	CIT3	YPR001W	1461 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	LSG1	YGL099W	1923 nt		5.05	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	RPP1	YHR062C	882 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	RPS5	YJR123W	678 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	GCV3	YAL044C	513 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	YLR312C	YLR312C	1197 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	ECM19	YLR390W	339 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	CAF40	YNL288W	1122 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	YPR160C-A	YPR160C-A	285 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	PMT3	YOR321W	2262 nt		5.04	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	BZZ1	YHR114W	1902 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	SUB2	YDL084W	1341 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	MCH1	YDL054C	1461 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	LCB3	YJL134W	1230 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	PEX13	YLR191W	1161 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	JNM1	YMR294W	1122 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	RKI1	YOR095C	777 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	PCS60	YBR222C	1632 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	ILV1	YER086W	1731 nt		5.03	□□□□□ -1.6
VMA11	P32842	SUF5	tG(CCC)O	72 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	HSP150	YJL159W	1242 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	YLR123C	YLR123C	330 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	YBR124W	YBR124W	360 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	CCC2	YDR270W	3015 nt		5.02	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	YPL102C	YPL102C	303 nt		5.01	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	YPR204W	YPR204W	3099 nt		5.01	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	EGD2	YHR193C	525 nt		5	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	OPI8	YKR035C	642 nt		5	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	YNL017C	YNL017C	339 nt		5	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	KTR1	YOR099W	1182 nt		5	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	YBR226C	YBR226C	411 nt		5	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	NSE5	YML023C	1671 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	YFR006W	YFR006W	1608 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	PPM1	YDR435C	987 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	LDS1	YAL018C	978 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	QCR8	YJL166W	285 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	POP5	YAL033W	522 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	YLR126C	YLR126C	756 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	NHA1	YLR138W	2958 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	ATF1	YOR377W	1578 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	ESC8	YOL017W	2145 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	DUG1	YFR044C	1446 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	YDL129W	YDL129W	876 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	RRP46	YGR095C	672 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	CIS3	YJL158C	684 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	SHP1	YBL058W	1272 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	IES2	YNL215W	963 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	CWC27	YPL064C	906 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	YMC1	YPR058W	924 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	MNS1	YJR131W	1650 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	STE13	YOR219C	2796 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	EXG1	YLR300W	1347 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	UTR2	YEL040W	1404 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	UTP4	YDR324C	2331 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	YDL172C	YDL172C	480 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	PRS2	YER099C	957 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	SYF2	YGR129W	648 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	ERP5	YHR110W	639 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	MRP51	YPL118W	1035 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	KEL1	YHR158C	3495 nt		4.96	□□□□□ -1.61
VMA11	P32842	ASK1	YKL052C	879 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	RRS1	YOR294W	612 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	YBR056C-B	YBR056C-B	159 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	YOL036W	YOL036W	2286 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	IMA5	YJL216C	1746 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	HAS1	YMR290C	1518 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	ADE12	YNL220W	1302 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	YDR034W-B	YDR034W-B	156 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	CDC34	YDR054C	888 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	COX5A	YNL052W	462 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	CSL4	YNL232W	879 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	MRPS16	YPL013C	366 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	YPL041C	YPL041C	624 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	TEL2	YGR099W	2067 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	MDM31	YHR194W	1740 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	YML133C	YML133C	4125 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	IDP3	YNL009W	1263 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	YNL042W-B	YNL042W-B	258 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	GDA1	YEL042W	1557 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	MTF2	YDL044C	1323 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	YCK1	YHR135C	1617 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	GPB2	YAL056W	2643 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	XBP1	YIL101C	1944 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	UGX2	YDL169C	672 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	DFM1	YDR411C	1026 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	TMT1	YER175C	900 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	OAC1	YKL120W	975 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	GEP5	YLR091W	882 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	CRZ1	YNL027W	2037 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	PYC2	YBR218C	3543 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	HRQ1	YDR291W	3234 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	PRI2	YKL045W	1587 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	YEL068C	YEL068C	333 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	LEU5	YHR002W	1074 nt		4.92	□□□□□ -1.62

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