Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAFP15056 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAFP15056 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAFP15056 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAFP15056 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAFP15056 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAFP15056 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAFP15056 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAFP15056 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAFP15056 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAFP15056 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAFP15056 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAFP15056 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAFP15056 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAFP15056 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAFP15056 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAFP15056 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAFP15056 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAFP15056 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAFP15056 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAFP15056 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAFP15056 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAFP15056 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAFP15056 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAFP15056 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAFP15056 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAFP15056 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAFP15056 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAFP15056 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAFP15056 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAFP15056 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAFP15056 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAFP15056 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAFP15056 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAFP15056 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAFP15056 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAFP15056 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAFP15056 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAFP15056 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAFP15056 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAFP15056 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAFP15056 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRAFP15056 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRAFP15056 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRAFP15056 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRAFP15056 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAFP15056 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAFP15056 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAFP15056 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAFP15056 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAFP15056 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAFP15056 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAFP15056 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAFP15056 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAFP15056 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAFP15056 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAFP15056 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAFP15056 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAFP15056 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAFP15056 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAFP15056 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAFP15056 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAFP15056 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRAFP15056 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRAFP15056 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRAFP15056 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BRAFP15056 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRAFP15056 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRAFP15056 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAFP15056 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms