Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM1P13688 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM1P13688 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms