Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms