Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD9O00233 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD9O00233 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD9O00233 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD9O00233 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD9O00233 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD9O00233 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD9O00233 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD9O00233 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD9O00233 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMD9O00233 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD9O00233 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD9O00233 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD9O00233 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD9O00233 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD9O00233 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD9O00233 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD9O00233 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD9O00233 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD9O00233 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD9O00233 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PSMD9O00233 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms