Protein–RNA interactions for Protein: E9PX37

Krtap27-1, Keratin-associated protein 27-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap27-1E9PX37 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krtap27-1E9PX37 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap27-1E9PX37 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap27-1E9PX37 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms