Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOD1A6NK06 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOD1A6NK06 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOD1A6NK06 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOD1A6NK06 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACOD1A6NK06 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACOD1A6NK06 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOD1A6NK06 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOD1A6NK06 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms