Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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TRBV2A0A0J9YWF9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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TRBV2A0A0J9YWF9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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TRBV2A0A0J9YWF9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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TRBV2A0A0J9YWF9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TRBV2A0A0J9YWF9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRBV2A0A0J9YWF9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TRBV2A0A0J9YWF9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRBV2A0A0J9YWF9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TRBV2A0A0J9YWF9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV2A0A0J9YWF9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV2A0A0J9YWF9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV2A0A0J9YWF9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV2A0A0J9YWF9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV2A0A0J9YWF9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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TRBV2A0A0J9YWF9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV2A0A0J9YWF9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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