Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms