Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms