Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms