Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms