Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC88CQ9P219 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms