Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GIN1Q9NXP7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms