Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms