Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms