Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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