Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GSDMCQ9BYG8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms