Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms