Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAAF4Q8WXU2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAAF4Q8WXU2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms