Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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